同治初年渭南县回村众多，遍布渭河两岸，有回民三万余人。清同治年间，发生持续十年之久的陕甘回民起义，渭南县是回民起义发生最早地点。

在大荔八女井和渭南孝义镇的反地主团练斗争，揭开了回民大起义的序幕。渭南仓头镇人任武率仓头镇一带回民，杀死团练大臣张芾，成为首义渭南地区的领袖之一。洪家村人洪兴，是渭南县衙差役，在回民中有威信和号召力，也是起义初期领导人之一。马彦英是渭南乔店人。马玉良是渭南北村里人。回民歌谣里说：“乔店村马彦英英雄好汉，北村里马玉良执掌兵权”。渭南回民起义领导人除上述以外，还有阎兴春、蓝明泰等。

起义军迅速扩大至10余万人，组成18个大营，由任武、赫明堂等分别统率，并推洪兴、任武为帅，统一指挥，一时形成了“东南西北，云起响应”的局势。渭南成为东路回民起义的中心。

左宗棠平息起义以后，9480名渭南县回民，被迁移安插到现宁夏自治区泾源县。一小部分渭南回民撤退到中俄边境的托克马克，其后代被称为东干人。至今有的仍以原村名称呼新建的村庄。当地方言、民俗也和渭南十分相近。

同治回民起义失败后，渭南县境内回民绝迹。临渭区目前有回民2500余人，主要是在民国时期，从河南、河北、西安等地迁移而来。其中河南籍回民占回民总数98%以上。另外有三户姓“从”的回民来自河北沧州。

民国时期，河南水旱迭起，饥荒连年，军阀混战不断。花园口黄河大堤决口后，郑州、荣阳、洛阳有相当数量的回民，逃荒投奔已在渭南县落户的亲戚、乡亲。此后，又有许多河南回民陆续来到渭南。

河南回民来到渭南后，最初是在今临渭区文化馆东的一个回民食堂后边做礼拜，由几位年长的老回民带领露天进行。民国21年，在现今渭南市西安路小学旁边，集资修建起清真寺。大家都在清真寺周边围寺而居。民国31年，另有百余回民从河南逃难到渭南城区，集居在一青里一带。

上世纪二十年代末、三十年代初，西安回族实业家白楚珍自上海回陕，在现今的临渭区刑警大队家属院位置，开办南棉花打包厂，由其儿子白毅青经营，将籽棉加工为絮棉，销往江、浙、沪纺织厂。南打包厂建成后，西安坊上有一部分回民闻讯前来，大多以经营餐饮业及民族小吃为主，也有一小部分进厂打工。其中打工的回民有三四十户，六七十人。