目前在西藏自治区境内有四座大小不等的清真寺，若追其来龙去脉，真还有一段说道半天的历史渊源。

西藏地区早在吐蕃时期即公元8世纪，就同阿拉伯的穆斯林商人有商业往来。11世纪，伊斯兰教在西藏西部的克什米尔地区兴盛，从而为更多的穆斯林商人到拉萨来经商创造了便利条件。至14世纪，在西藏拉萨城内做生意的克什米尔穆斯林商人，开始定居落户，并逐步形成一群新兴的民族群体，同时也有了自己的族名，即卡切（kha-che），这是藏族人给他们起的称呼，意为穆斯林人。

由于西藏地区一直盛行藏传佛教，尤其拉萨城是藏传佛教的圣地，伊斯兰教在拉萨始终没能发展起来，特别是第五世达赖喇嘛（1617—1682）执政时期，藏传佛教格鲁派在西藏蓬勃发展，压制了来自克什米尔的伊斯兰教的扩张势力，使西藏的伊斯兰教只是在穆斯林商人和屠夫中传播，其信仰范围十分狭小单一。但是藏族人离不开穆斯林人，一是因为拉萨市场需要穆斯林商人来支撑，二因为藏区城镇需要宰杀牲畜的专业屠夫。而藏族人长期受藏传佛教的熏陶和受宗教观念的影响，经商意识淡泊，尤其忌讳杀生。现实社会的需求，使信仰伊斯兰教的穆斯林最终在西藏地区生根发芽。

有关史料记载，在拉萨城出现的第一座清真寺始建于康熙年间即1716年，是今位于拉萨市城关区河坝林（八廓街以东300米入口处）的清真寺，现称拉萨大清真寺。最初该清真寺规模较小，占地仅有200平方米；1793年，清朝政府派兵平定廓尔喀人入侵后藏事件后，拉萨清真寺得到维修和扩建，说明当时清军中或随清军入藏的有不少内地穆斯林人；在历史上清真寺内还有一块题写“咸尊正教”的匾额，立匾年号为乾隆三十一年即1766年，这又说明内地穆斯林人早已在拉萨定居。1959年西藏少数上层分裂主义分子发动武装判乱，清真寺也被叛军烧毁；1960年又得重建；1978年中央十一届三中全会以后，再次得到维修；1985年庆祝西藏自治区成立二十周年时，中央代表团向拉萨大清真寺赠送了题写“清真古寺”的匾额，现悬挂在大门上。

目前，拉萨大清真寺占地面积达2600平方米，其中建筑面积就有1300平方米，整个院落东西长，南北短，建筑结构由大门、前院、宿舍、宣礼塔、礼拜堂、浴室等组成。其中大门朝北，庄严肃穆；宣礼塔是一座高13米周长13米的四层六角塔，为石木结构，十分精巧，礼拜堂是主体建筑，矗立在高出地面一米左右的平台上，座西朝东，内有13根柱子，整个建筑占地面积达285平方米，堂内铺有大型地毯，西壁挂有麦加天房挂毯，北侧设有阿訇讲经的台座，呈现一派洁净清雅之氛围。

另外，拉萨市内还有一座清真寺，现被称为拉萨小清真寺，位于今拉萨市城并区河坝林即八廓街东南200米处，建于20世纪20年代。据史料记载，这座清真寺是为了外地穆斯林人作礼拜而专门建造的，当时主要是来自克什米尔和拉达克、尼泊尔等地的穆斯林商人来这座清真寺里作礼拜。这座清真寺的建筑规模很小，礼拜堂面积只有130平方米，但是其结构形式别具一格，是一座典型的藏式建筑物。

这些保证了在拉萨市内定居或旅居的伊斯兰教信仰者，不但有一个自由而宽松的过正常宗教生活的场所，而且还有两处按照穆斯林习俗建立的墓地，即拉萨北郊的夺底山沟的墓地和拉萨市西郊的吉采鲁丁的墓地。拉萨的穆斯林人每年8月份有一个叫做“抓饭节”的特别节日。这一节日在拉萨北郊夺底沟的伊斯兰教坟墓园林举行，穆斯林们在那里过十天的露营生活，其间阿訇讲《古兰经》，并举行礼拜、祈祷等宗教仪式。另外，从1984年开始，每年都有拉萨穆斯林人乘机飞往沙特阿拉伯的麦加朝圣。

除上述拉萨市内的两座清真寺外，在西藏日喀则市内和西藏昌都县城关镇分别还有一座清真寺。

西藏自治区境内究竟有多少信仰伊斯兰教的信徒呢？从历史上看，1903年在拉萨共有200多名从拉达克和中国西部来的穆斯林人，他们主要从事经商活动，当时在拉萨不仅有清真寺，还有一个由中国西部穆斯林人开办的清真饭庄；1936年，仅从拉达克来的穆斯林就达两三百人，他们大都身穿藏装，但缠头或戴盖头，在饮食方面，也喜欢吃肉和糌粑，喝奶茶或酥油茶。

1964年，西藏自治区内有1195名穆斯林人；1982年已增至1788人；1992年又增加到2097人，其中居住在拉萨市内的穆斯林近2000人，约占西藏穆斯林总数的三分之二强。现西藏自治区内伊斯兰教徒约有5000人。此外，还有为数不多的其他民族或外籍的穆斯林，无论是旅居还是定居拉萨的穆斯林，都能够按照自己的信仰，过正常的宗教生活。

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如今，世居拉萨的穆斯林的语言已经藏语化，服装已经藏族化，他们在保持自己宗教信念和生活习俗的同时，与当地的藏族僧俗也相处得和谐友好。日常交际语言多为藏语或汉语，做礼拜时，先用阿拉伯语诵经，然后再用藏语读译文。