中国各族穆斯林历来有爱国主义的光荣传统。他们反对民族分裂，反对外来侵略，为保卫祖国的完整和统一做出过巨大贡献。

在大小和卓叛乱及其以后和卓后裔勾结外来侵略势力进行分裂祖国的历次活动中，各族广大穆斯林群众都坚决站在祖国一边，参加平叛大军。如在讨平张格尔叛乱时，维吾尔族人民冲锋陷阵，英勇杀敌，探查敌情，传送情报，运输军需物资，修路架桥，为清军充当向导。在遭叛匪俘获时，他们痛斥敌人暴行，宁死不屈；在叛匪收买引诱时，他们立场坚定。忠于祖国。在和田、叶尔羌，他们曾活捉张格尔的亲信，杀死叛军；在喀什噶尔，曾多次发生谋杀张格尔事件，在张格尔溃逃出卡时，维吾尔、塔吉克、哈萨克、柯尔克孜人民英勇出击，协同清军追捕叛匪，为活捉张格尔，彻底平叛做出了卓越贡献。

浩罕挟持玉素甫和卓入侵失败后，曾劫掠1200余群众。途中，英吉沙的69名维族穆斯林，半夜砍杀侵略者，逃出虎口，回到祖国。

道光十六年(1836年)十一月，浩罕再次入侵色勒库尔。当地塔吉克人民在其领袖库尔察克,、吐尔阿沙等先后领导下，奋勇抵抗，偷袭敌营，狠狠打击了侵略者的气焰。

咸丰五年(1855年)，沙俄驻塔城领事残害我雅尔噶图金矿人民200余名，塔城回族人民与汉族一起在徐天荛、安玉贤领导下，举行了焚烧沙俄贸易圈的斗争.
 
同治初，沙俄全面入侵我国西北地区。强迫清政府签订了不平等的《中俄勘分西北界约记》，引起新疆穆斯林一系列抗俄斗争。

阿古柏匪帮统治时期，初期有色勒库尔塔吉克人民起义，柯尔克孜人民起义；中期有吐鲁番农民反对征收“种子税”起义，乌鲁木齐回汉人民反侵略、反屠杀的起义；后期有南疆各地维、回、柯尔克孜等族人民普遍掀起的武装斗争。

光绪二十年（1894年），回族穆斯林将领左宝贵奉命进援朝鲜，抗击日寇，保卫祖国安全。他在平壤力疾血战，奋不顾身，身负重伤仍坚守炮台督队，直至中弹牺牲。

光绪二十六年(1900年)，八国联军进袭北京。从天津至北京，一支主要由回族、东乡族穆斯林组成的中国部队进行了英勇顽强的抗击，使侵略者伤亡惨重。正阳门保卫战中，穆斯林将领马福禄援兵登城。谋夺回城楼，破敌卡七道，不幸中弹。英勇捐躯，名标青史。

中国各族穆斯林这种爱国主义传统。在1937—1945年伟大的抗日战争中，得到更好的继承和发展，涌现了数以万计的抗日英雄。著名的冀中国民支队司令员马本斋及其母，被朱德总司令誉为“大节不死，母子两代英雄”。他所领导的回民支队及张风亭领导的渤海回民支队、白云义领导的安徽定远县二龙乡清真营，都是令日寇胆寒的人民子弟兵。中国穆斯林与其他民族人民一起，用血肉之躯筑成一道伟大中国的“新的长城”，在这场神圣的反法西斯战争中，保卫了祖国，打击了日寇，贡献了自己的一切。