贾比尔被认为是化学的开拓者，他引进了一些早期实验性质的科学方法，还有蒸馏器、制酒蒸馏器、曲颈瓶及纯蒸馏、过滤、升华、液化、结晶、提纯、氧化还原、蒸发。 　　
 

    肯迪、比鲁尼、伊本•西那及伊本•赫勒敦先后批驳传统炼金术及贤者之石的论说。穆罕默德•伊本•扎卡里亚•拉齐（Muhammad ibn Zakariya al-Razi）在他的著作《盖伦的疑惑》（Doubts about Galen）里首次利用实验来证明亚里士多德四元素说及盖伦体液学说（Humorism）的谬误。纳西尔丁•图西陈述了早期的质量守恒定律，认为物质本身可以转化，但是没法消失。学者亚历山大•冯•洪堡和威尔•杜兰特（Will Durant）认为中世纪的穆斯林化学家是化学的创立者。
数学
 

　　穆斯林数学家在这个时期的成就包括波斯籍伊斯兰数学家花剌子密发展的代数及算法、球面三角学的发明，在阿拉伯数字里加入应用小数点、除了正弦外所有三角函数的发现、肯迪引入的密码分析及频率分析、卡拉吉（Al-Karaji）引入的代数演算及运用数学归纳法证明、海什木的解析几何及最早用于无穷小量及积分学的通用公式、欧玛尔•海亚姆开创的代数几何、纳西尔丁•图西率先对欧几里得几何的反驳及其平行公设、萨德雷丁对非欧几里得几何的率先涉猎[、阿布•哈桑•伊本•阿里•加拉萨迪（Abū al-Hasan ibn Alī al-Qalasādī）的数学符号以及其他大量在代数、算术、微积分、密码学、几何学、数论、三角学方面的发展。
 

    医学
 

     伊斯兰医学受到各类不同的医学体系影响，古希腊及古罗马医学家希波克拉底、迪奥斯科里斯（Dioscorides）、索拉努斯（Soranus）、塞尔苏斯及盖伦的著作都对伊斯兰医学产生持久的影响。 　　
 

    穆斯林医学家对医学作出了许多重要的贡献，包括解剖学、医学研究、眼科学、病理学、制药学、生理学、外科学等。他们设立了一些最早的专科医院，包括第一所医学院和第一所精神专科医院。肯迪在他的著作《De Gradibus》里说明了量化及数学在医药里的应用，如以数学刻度来表示药物的效用、计算病症最危急的时期。拉齐发现了麻疹及天花，又在他的《盖伦的疑惑》里论证了盖伦体液学说的谬论。 　　
 

     医学家宰赫拉威为现代外科学奠下了基础，据他的《医学宝鉴》（al-Tasrif）里记载，他发明了大量的外科手术，包括分娩、外科专用的肠线、手术镊、结扎线、外科缝合针、手术刀、刮匙、牵开器、手术匙、探子、手术钩、手术棒、窥镜及骨锯。海什木在《光学书》里首先解释了视觉和视知觉的过程，推进了眼部手术的发展。 　　
 

     伊本•西那为现代医学奠下了基础，其著作《回回药方》将系统化的实验及量化应用到生理学里，他发现了传染病及采用隔离检疫措施来阻止传染病扩散，引进医学实验、循证医学、临床试验、随机对照试验、效能测试及临床药理学，又首先描述了细菌和病毒，区分出胸膜炎与纵膈炎。除此之外，他又发现了结核的传染性、疾病透过水、土壤、表皮接触、性、反常行为、神经系统传播，利用冰来治理发热征状及区分医学及药理学。 　　
 

    伊本•苏尔（Ibn Zuhr）是已知最早的实验外科医生，他在12世纪将试验法引入到外科手术，他是在对病人实施外科手术之前进行动物试验的第一人，又首先对人类和动物实施解剖及验尸。 　　
 

    伊本•纳菲斯则为心血管生理学奠下基础，他是描述肺循环和冠状血管的第一人，构建了循环系统的基础，因而被视为中世纪“最伟大的生理学家”。他又是代谢概念的第一个描述者，不相信伊本•西那及盖伦的体液学说、脉搏、骨骼、肌肉、肠脏、感觉器、胆汁管、食道、胃等理论，并创立了生理学及心理学的新模式来取代它们。 　　
 

    伊本•卢布迪不认同体液学说，他发现对身体的保存取决于血液、女性不能生产精子、动脉的活动不依赖于心脏的活动、心脏是胎儿形成的第一个器官、颅骨可生成肿瘤。伊本•克蒂马及伊本•哈提卜发现微生物入体可致传染病。曼苏尔•伊本•伊利亚斯（Mansur ibn Ilyas）绘画了人体结构、神经系统及循环系统的详细图像。
 

    物理学
 

    海什木开创了对实验物理学的研究，他是现代光学的开拓者，其著作《光学书》倡议实验科学方法，以此彻底转变人们对光及视知觉的认识。《光学书》开创了光学及视知觉的科学革命，因而被艾萨克•牛顿的《自然哲学的数学原理》评为物理学史上最具影响力的书籍之一。 　　
 

    比鲁尼则将实验科学方法应用到力学上，多位穆斯林科学则发现了牛顿运动定律的前身。牛顿的第一个运动定律惯性定理及动量是由海什木和伊本•西那所发现。力和加速度的比值是由希巴特•阿拉•艾布柏巴拉卡特•巴格达迪（Hibat Allah Abu'l-Barakat al-Baghdaadi）所发现，这是“经典力学的基本法则”，为牛顿的第二个运动定律埋下伏笔。后来演变成牛顿第三个运动定律的反作用力则由伊本•巴哲所发现。加尔法•穆罕默德•伊本•穆萨•伊本•沙基尔（Ja'far Muhammad ibn Mūsā ibn Shākir）、海什木及哈齐尼（Al-Khazini）为牛顿万有引力定律铺垫了一些相关的理论。伊本•西那对伽利略•伽利莱的加速度数理及他的惯性原理受进行评注而使之更加充实。